Predictia duratei de viata la diferite specii pe baza caracteristicilor AND-ului mitocondrial

Splaiul Independenţei 296, București, Romania

Responsabilități

Proiectul are ca scop folosirea invatarii automate pentru prezicerea duratei de viata la diferite specii, pe baza unor caracteristici adnotate sau calculate ale AND-ului mitochondrial.

Proiectul va folosi ca material datele din baza de date MitoAge, o baza de date publica, cu date calculate sau colectate manual, precum si datele despre durata de viata din baza de date AnAge. Algoritmul implementat va invata din datele existente in prezent, folosind invatare automata supervizata. Modelele de “estimatori” create vor fi comparate, evaluand precizia de predictie prin “cross validation”. Pentru reducerea numarul de attribute relevante, pot fi folosite si tehnici specifice de invatare automata (e.g. decision trees). Modulul dezvoltat va fi integrat in baza de date MitoAge.

Date disponibile: MitoAge contine ~1000 specii cu ~100 atribute calculate pentru fiecare specie.
Link-uri utile:

MitoAge – http://www.mitoage.info/
AnAge – http://genomics.senescence.info/specie/

Proiectul va fi realizat in colaborare cu Computational Biology of Aging Group,
Institute of Biochemistry, Romanian Academy.