Sistem de clusterizare a datelor microarray din experimente diferite

Splaiul Independenţei 296, București, Romania

Responsabilități

Proiectul propune evaluarea diferitelor metrice de similaritate intre matrici aplicate pentru date microarray din domeniul biologiei si dezvoltarea unui algoritm de clustering (invatare nesupervizata) pe baza acestor metrici. Algoritmul va tine cont si de o meta-normalizare inter-matrici. De notat, se doreste ca algoritmul sa functioneze pentru un numar mare de array-uri (10^4-10^5), fiecare reprezentand o matrice patratica cu ordin 10^4.
Rezultatele algoritmului vor fi validate prin comparatie cu un clustering bazat pe keywords asociate array-urilor.

Proiectul va fi realizat in colaborare cu Computational Biology of Aging Group,
Institute of Biochemistry, Romanian Academy.